Os organismos Unikonta igualmente se caracterizam por tripla fusão de
genes que não existe nos Bikonta, assim como um único
centríolo (Cavalier-Smith, 2002, 2006). Alguns Unikonta apresentam dois centríolos, porém sua origem difere evolutivamente dos Bikonta, indicando aqui uma convergência evolutiva (Cavalier-Smith 2006). Os três genes que estão fundidos nos Unikonta, porém não nas
bactérias e nem nos Bikonta, codificam as
enzimas que intervêm na síntese dos
nucleotídeos pirimidínicos carbamoil-fosfato sintase, dihidroorotase e aspartato carbamoiltransferase (Cavalier-Smith 2006). Parece provável que esta tripla fusão seja o resultado de duas duplas fusões sucessivas, uma corrente de eventos rara na evolução e com poucas possibilidades de se repetir. Este fato apoia a teoria que propõe um antepassado comum para Opisthokonta e Amoebozoa.