O porto pertence à
União, e o Governo Federal é responsável por sua administração por meio da
Companhia das Docas do Estado da Bahia (CODEBA). A CODEBA foi instituída para gerenciar e distribuir as cargas em todo o estado da Bahia. Para garantir operações eficazes, a empresa viabilizou uma moderna
infraestrutura e suporte
tecnológico para o Porto de Salvador, o que inclui um novo terminal de passageiros, além de outras intervenções que visam melhorar não só a infraestrutura do porto mas também a recepção
turística.