A maioria destes organismos medem por volta de 50
µm e têm um único núcleo associado a quatro flagelos. Os seus
corpos basais originam vários grupos de
microtúbulos que formam um
orgânulo denominado
axostilo, o qual possui uma estrutura diferente da dos axostilos de Parabasalia. Uma fibra associada denominada preaxostilo separa os flagelos em dois pares. Alguns Oxymonadida têm múltiplos núcleos, flagelos e axostilos.
O flagelado de vida livre
Trimastix está estreitamente relacionado com o Oxymonadida. Carece de mitocondrias e tem quatro flagelos separados por um preaxostilo, no entanto, ao contrário do Oxymonadida possui um suco de alimentação. Esta característica coloca a Oxymonadida e a
Trimastix entre os
Excavata e, mais concretamente, nos
Metamonada.