A região que drena a parte oriental do estado é a bacia hidrográfica do Atlântico Sul. O Itajaí é o rio mais importante dessa parte de Santa Catarina. No centro e no oeste, estão localizados afluentes do rio Uruguai, como o Pelotas, o Canoas, o do Peixe e o Chapecó. Esses cursos d’água fazem parte da Bacia Hidrográfica do Rio Uruguai.

Santa Catarina tem um clima subtropical úmido. As temperaturas médias são muito variáveis conforme o local: são as de menor temperatura nas regiões serranas (onde pode nevar no inverno) e de maior temperatura no litoral, no sudeste e no oeste catarinense. As chuvas têm boa distribuição no decorrer do ano, sendo atingidos, em média, 1.500 mm anuais. Nas suas origens históricas, a vegetação que recobria o estado era de florestas e campos. Nas serras litorâneas era predominante a Mata Atlântica e, nos trechos de maior elevação das regiões serranas, a Mata de Araucárias. Os campos são visíveis em manchas que se espalham pela totalidade do estado.