Apesar do Estado Secreto, ter amplo apoio durante a maior parte da guerra, não foi apoiado e reconhecido pela Extrema-esquerda  (comunistas). Os nacionalistas da Falange Nacional Radical e do Acampamento Radical Nacional contra a ocupação alemã da Polônia, foram rapidamente substituídos pela Konfederacja Narodu, uma parte do Estado polaco secreto que também incluiu a maioria dos membros pré-guerra de Extrema-direita. A influência dos comunistas eventualmente caiu em meio a reveses militares (mais notavelmente, o fracasso da Revolta de Varsóvia) e da crescente hostilidade da URSS. A União Soviética tinha criado um governo fantoche alternativo, em 1944 (o Governo de Lublin) e assegurou a formação da base do governo pós-guerra na Polônia. Durante a tomada comunista pró-soviética da Polônia no final da guerra, muitos membros do Estado Secreto foram processados ​​como traidores e muitos morriam no cativeiro. Abandonados pelos aliados ocidentais, descobriram ser impossível negociar com os soviéticos, e desejosos de evitar uma guerra civil, as instituições-chave do Estado Secreto dissolveram-se no primeiro semestre de 1945.

Em última análise, centenas de milhares de pessoas foram diretamente envolvidas com várias agências do Estado Secreto (as estimativas para a adesão ao exército de livre resistência Armia Krajowa apenas, muitas vezes são dadas por quase meio milhão de pessoas), sabendo que foram discretamente apoiadas por milhões de cidadãos poloneses. A lógica por trás da criação da autoridade civil chamou atenção do fato de que a ocupação alemã e soviética da Polônia era ilegal. Assim, todas as instituições criadas pelas potências ocupantes foram considerados ilegais, e instituições polonesas secretas paralelas foram criadas de acordo com a lei polaca. A escala do Estado secreto também foi inadvertidamente ajudada pelas ações dos ocupantes, cujas tentativas de destruir o Estado polonês, nação e sua cultura, incluindo o mais importante, políticas genocidas que tiveram como alvo cidadãos poloneses, o apoio popular movidos para o movimento de resistência polonesa e o seu desenvolvimento.