Apresentam um ou dois plastos, com ou sem pirenóides. Os plastídeos apresentam os tilacóides agrupados em pares, sem lamela. Com clorofila a e c; apresentam a-caroteno e xantofilas, aloxantina dominante, no entanto falta o ß-caroteno. Possuem pigmentos ficobilínicos (ficocianina ou ficoeritrina), mas não se apresentan em ficobilissomas. Utilizam como material de reserva, amido verdadeiro, extraplastidial, associado com plastos e núcleo.

Apresentam dois flagelos anteriores quase iguais que saem de um reservório revestido por tricocistos, ambos são pleuronemáticos. Podem ter uma parede celular de celulose, apresentam um periplasto de três camadas, também podem apresentar placas poligonais externas. As mitocôndrias têm cristas planas, e a mitose é aberta. A reprodução é por bipartição, mediante zoósporos e cistos. En alguns casos observou-se também reprodução sexual.