MER est un acronyme pouvant se référer à plusieurs significations :

• Mars Exploration Rover, deux astromobiles de la NASA situés sur Mars depuis 2004.
• Mouvement pour la réforme européenne
• Maître d'enseignement et de recherche

Le terme générique de mer recouvre plusieurs réalités et peut désigner une grande étendue d’eau salée différente des océans, l'ensemble des espaces d'eau salée en communication libre et naturelle sur toute l'étendue du globe ou encore une grande étendue sombre à la surface de la Lune.

• La mer, grande étendue d'eau ;
• une mer, ou maria, tache sombre de la surface lunaire ;
• Mer, une commune française de Loir-et-Cher ;
• Mer, une langue papoue ;
• , l'acronyme de :
  • la mission Mars Exploration Rover sur la planète Mars, avec :
    • MER-A, le robot Spirit ;
    • MER-B, le robot Opportunity.
  • Mouvement pour la réforme européenne
  • Maître d'enseignement et de recherche
• Francis Mer (né en 1939), un industriel et homme politique français, ministre de l'Économie, des Finances et de l'Industrie de 2002 à 2004.
• Le projet Mer est un système d'exploitation ; c'est un dérivé communautaire de MeeGo dont il reprend les bases (GNU/Linux, Qt, WebKit).
• Mer est un composant toponymique spécifique aux Hautes-Vosges pour désigner un lac. Ailleurs (Normandie, Picardie, etc.), cet appellatif toponymique fait référence à toutes sortes de plans d'eau (mare, étang, lac)