Em 1891, a construção da linha Transiberiana começou em ambos os extremos. A equipa oriental partiu de Vladivostok na direção norte, percorrendo logo a margem direita do rio Ussuri até chegar a Khabarovsk, onde a linha cruzava o rio Amur numa grande ponte. Este foi o primeiro trecho da Transiberiana que foi terminado e entrou em serviço em 1897, conhecida como a linha do Ussuri, com mais de 750 km de comprimento.

O conflito fronteiriço sino-soviético decorreu nas proximidades deste rio em 1969. O momento mais grave foi o combate entre tropas chinesas e soviéticas pela ilha de Zhenbao ou Damanski, então controlada pela URSS. Em 1991 o governo russo aceitou reconhecer a soberania chinesa sobre muitas das pequenas ilhas situadas no rio como gesto de boa vontade para colocar um fim às disputas territoriais entre os dois países.