Mutagénese sítio-dirigida ou mutagénese sítio-específica é uma método de biologia molecular usado para realizar alterações específicas e intencionais na sequência de ADN de um gene ou de quaisquer produtos génios. É usada na investigação da estrutura e atividade biológica do ADN, ARN e moléculas de proteínas, e em engenharia de proteínas.