En géographie, une mer marginale peut être synonyme de mer épicontinentale ou de mer bordière. Dans un contexte géologique, une mer marginale ou bassin marginal est un bassin arrière-arc rempli. C'est donc une mer située sur une marge active, comprise soit entre un arc insulaire et un continent, soit entre deux arcs insulaires. Elles sont créées par la subduction de la lithosphère océanique sous une autre lithosphère océanique, la lithosphère continentale qui forme l'arc insulaire n'étant pas assez épaisse pour remplir son rôle classique dans une subduction lithosphère océanique / lithosphère continentale.