Genética ecológica é o estudo da genética no contexto das interações entre organismos e destes com o meio ambiente. Enquanto a genética molecular estuda a estrutura e função de genes a nível molecular, a genética ecológica (e o campo de estudo relacionado da genética de populações) estuda a evolução fenotípica em populações naturais. A pesquisa nesse campo é focada em características de significância ecológica - ou seja, caracteres relacionados à aptidão, plasticidade fenotípica e norma de reação que afetam a sobrevivência e reprodução (por exemplo, tempo de floração, tolerância a seca, padrão de coloração e razão sexual).