La filogenesi o filogenetica o filogenia, (dal greco φυλή ("classe", "specie") e ɣένεσις ("nascita", "creazione", "origine")), è il processo di ramificazione delle linee di discendenza nell'evoluzione della vita. La sua ricostruzione è fondamentale per la sistematica che si occupa di ricostruire le relazioni di parentela evolutiva, di gruppi tassonomici di organismi a qualunque livello sistematico.