Der Zentralzylinder ist ein Begriff aus der Botanik. Er bezeichnet den zentralen Teil der Wurzel sowie der Sprossachse von Gefäßpflanzen. Nach außen folgt die primäre Rinde. In der Wurzel bildet das Pericambium (Perizykel) die äußerste Schicht des Zentralzylinders und grenzt diesen gegen die Endodermis, die innerste Rindenschicht, ab.