Humboldt Universität, conosciuta con questo nome dal 1949. Venne fondata ad opera di Wilhelm von Humboldt (al quale è ora dedicata) nel 1809-1810 col nome di Alma mater beroliniensis. Nel 1828 assunse il nome di Friedrich Wilhelms Universität. Un tempo era chiamata spesso Universität Berlin (Università di Berlino), senza altre specificazioni, essendo l'unica università di Berlino.
Freie Universität Berlin, fondata nel 1948 a Berlino Ovest. Attualmente (2008) è la più grande università di Berlino.
Technische Universität Berlin, fondata nel 1879, è la continuazione antiche istituzioni scientifiche Bergakademie (1770), Bauakademie (1799), Technischen Schule (1821) e Technischen Hochschule Charlottenburg (1879)