In anatomia umana, il sistema linfoide comprende:

• organi linfoidi primari: midollo osseo e timo;
• organi linfoidi secondari: milza, linfonodi e MALT (tessuto linfoide associato alle mucose).

In altri animali, come per esempio gli uccelli, al sistema linfoide appartengono altri organi, come la borsa di Fabrizio.