La segunda Junta de Gobierno de Quito fue el gobierno ejecutivo que se creó en la Presidencia de Quito a raíz de la llegada al territorio del coronel Carlos de Montúfar, nombrado comisionado de regencia por la Junta Central de Sevilla. Gobernó legalmente a nombre de Fernando VII entre el 1 de septiembre de 1810, cuando se instaló, y el 9 de octubre de 1811, cuando se disolvió y sus miembros obligaron al conde Ruiz de Castilla a renunciar a la presidencia una vez más, declarando la independencia absoluta del Estado de Quito.