O jogo se foca na história do
Prince da
Pérsia que, enganado pelo
Vizier, liberta as
Sands of Time ("Areias do Tempo") no palácio do sultão, um amigo de seu pai, o rei Shahraman. As Areias do Tempo transformam todos os habitantes do palácio em monstros de areia, colocando-os sob o controle do Vizier. Com a ajuda da princesa Farah, a filha do
marajá da
Índia, o jogador deve controlar o Prince e usar as suas habilidades acrobáticas e a
Dagger of Time ("Adaga do Tempo") para atravessar todas as áreas do palácio repletas de armadilhas e desfazer o seu erro.