Von Guericke fu studente dal 1617 al 1619 presso l'Università di Lipsia, dal 1621 al 1623 presso l'Università di Jena e dal 1623 al 1624 a Leida. I suoi studi spaziarono dal diritto all'ingegneria civile. In seguito compì un viaggio d'istruzione in Francia ed in Inghilterra, tornando a Magdeburgo solo nel novembre del 1625. Nel 1626 sposò Margaretha Alemann e fu eletto nel consiglio della sua città natale. Nei tre anni successivi ebbe tre figli, nell'ordine Anna Katharina, Otto e Jakob Christoph. Nel 1646 divenne uno dei quattro borgomastri della città di Magdeburgo.