No período entre-guerras Wainwright serviu e comandou diversas unidades da cavalaria, até ser promovido a brigadeiro-general em
1938. Neste posto foi designado para
Manila, onde assumiu a chefia do departamento filipino do exército em
1940. Como comandante de campo das forças filipinas e americanas no país, abaixo apenas do general
Douglas MacArthur, ele foi o responsável pela resistência dos
Aliados à invasão japonesa do país em seguida ao ataque em
Pearl Harbor, que levou a Segunda Guerra Mundial ao
Pacífico com a entrada dos EUA na guerra.