Pesquisa recente, contudo, tem duvidado disso, uma vez que o Mosteiro Novo continuou a operar no período otomano, enquanto a Igreja do Profeta Elias foi convertida em mesquita por imediatamente após a captura da cidade em 1430. Com base em sua decoração interna, tem sido sugerido que a igreja era o católico do importante Mosteiro de Acapnios.

Seu estilo arquitetônico, uma variação da igreja de cruz inscrita conhecida como o "tipo Atonita", é única na cidade, e foi sempre reservada aos católicos dos mosteiros. A cuidadosa alvenaria, de alternados cursos de tijolos e silhares brancos, é também incomum de Salonica e sua região; é uma cópia da arquitetura constantinopolitana. Fragmentos da decoração original da igreja sobreviveram na forma de pinturas murais, ricos exemplos da arte paleóloga tardia, que influenciou pintores posteriores na Sérvia.