Em 1994, a Igreja Ortodoxa Copta, que é a igreja-mãe da Igreja Ortodoxa Etíope, indicou um arcebispo para a Igreja Ortodoxa Eritreia. Esta igreja nacional obteve também sua autocefalia em 1998, com a consagração do seu primeiro Patriarca eritreu pelo Papa da Igreja Copta. Assim sendo, a Igreja Tewahido Eritreia é atualmente uma Igreja autocéfala independente da Igreja Ortodoxa Copta e da Igreja Ortodoxa Etíope.

Uma das poucas igrejas cristãs pré-coloniais da África subsariana, possui atualmente cerca de 2,5 milhões de fieis. Atualmente, a Igreja Ortodoxa da Eritreia é governada pelo Patriarca Abune Dioskoros, juntamente com o seu Sínodo. Esta Igreja oriental utiliza a língua ge'ez na sua liturgia.