est vice-shogun du clan Hosokawa et le fils de Hosokawa Katsumoto. Masamoto est nommé à ce rang durant l'année 1486. Pendant une brève période, ce titre est perdu par Hatakeyama Masanaga, mais récupéré avec le temps. Lorsque Ashikaga Yoshihisa meurt sans enfants en 1489, Masamoto soutient la nomination d'Ashikaga Yoshizumi comme successeur. Masamoto pense que le poste de vice-shogun doit revenir à Hosokawa Masanaga, en raison de la proximité de Hosokawa Yoshitane avec Hatakeyama Masanaga, et de ses propres objections à l'élévation de Yoshitane. Au cours de la lutte de Masanaga avec une branche rivale du clan Hatakeyama, Yoshitane conduit des troupes à l'aide de Masanaga. Masamoto aide ensuite les Hatakeyama avec ses propres forces et vainc finalement celles de Masanaga et Yoshitane. Masanaga se suicide lors de la bataille et Yoshitane revient prisonnier à Kyoto.