Blainville nacque ad Arques, nei pressi di Dieppe. Intorno al 1796 si recò a Parigi per studiare disegno, ma alla fine dedicò tutto sé stesso alla storia naturale ed attrasse l'attenzione di Georges Cuvier, il quale aveva tenuto occasionalmente delle lezioni al College de France e all'Athenaeum. Nel 1812 venne aiutato da Cuvier ad ottenere la cattedra di anatomia e zoologia alla Facoltà di Scienze di Parigi, ma in seguito tra i due nacque una reciproca discordia che sfociò in ostilità aperta.