Nacque a Nîmes da una famiglia borghese ugonotta. I suoi genitori si sposarono segretamente con rito protestante. L'8 aprile 1794 suo padre Andrea Guizot, accusato di federalismo fu giustiziato a Nimes nel pieno del Terrore. Da questo momento fu sua madre ad occuparsi della sua educazione. Era una donna fisicamente fragile, dai modi semplici ma con una grande forza di carattere. Era una tipica ugonotta, fortemente credente e rigidamente fedele ai suoi principi e animata da un forte senso del dovere. A questi principi modellò il carattere di suo figlio di cui condivise tutte le vicissitudini della sua vita. Esiliati da Parigi durante la Rivoluzione si rifugiarono a Ginevra dove Guizot fu educato secondo i principi liberali di Jean Jacques Rousseau. Secondo le teorie pedagogiche dell'Emilio di Rousseau il giovane Guizot dovette anche imparare un lavoro manuale. Fu così che apprese il mestiere di falegname e costruì egli stesso un tavolo che conservò sempre. Tuttavia Guizot nella sua autobiografia "Ricordi del mio tempo" omette tutti i dettagli della sua infanzia.