Filoctetes era um dos Argonautas, bem como amigo pessoal e mestre de armas de Héracles, estando presente no episódio da morte do herói. Por causa de ter sido Filoctetes a acender a pira funerária (fontes dizem que terá sido Iolau), foi ele quem recebeu o arco e flechas de Héracles. As flechas foram mergulhadas na bílis venenosa da Hidra de Lerna. Filoctetes jurou solenemente nunca revelar o local das cinzas de Héracles.