Os gêneros Euglena e Peranema estão entre os mais familiares. O corpo é alongado com uma invaginação, o reservatório, na extremidade anterior. O citóstoma está na base do reservatório e ligado a uma citofaringe. Algumas espécies possuem vacúolo contrátil que descarrega no reservatório, e dois flagelos, cada um apresentando uma série de mastigonemas.

Uma característica interessante dos euglenóides é que, quando submetidos a situações adversas, em que a fotossíntese seja dificultada pela falta de iluminação, eles podem adquirir características de protozoários e se alimentar, como um ser heterótrofo.