A alegação central que o Discovery Institute faz com o Ensine a Controvérsia é que a imparcialidade e igualdade de tempo requerem que os alunos sejam ensinados uma "Análise crítica da evolução" onde "um amplo escopo de visões científicas", "questões não resolvidas" da evolução, e as "fraquezas científicas da teoria evolucionária" são apresentadas e avaliadas ao lado de conceitos do design inteligente como a complexidade irredutível, e oferecidas como argumentos contra a evolução através de referências oblíquas a livros de autores defensores do design inteligente, listados na bibliografia do plano de lição "Análise Crítica da Evolução" proposto pelo Instituto. A comunidade científica e organizações de educação científica já responderam que na verdade não existe nenhuma controvérsia em relação a validade da evolução e que a polêmica existe unicamente em termos religiosos e políticos.

A campanha Ensine a Controvérsia do movimento do design inteligente é ditada a apoiada majoritariamente pelo Discovery Institute, um think tank cristão conservador  baseado em Seattle, Washington, EUA. O objetivo principal do movimento é "derrotar [a] visão de mundo materialista" representada pela teoria da evolução e a substituí-la como uma "ciência consoante com convicções cristãs e teístas".