Entre 1070 e 1180, a Baviera era contra o imperador, numa resistência liderada principalmente pela Casa de Guelfo. no conflito final entre o duque
Henrique, o Leão, e o imperador
Hohenstaufen Frederico I, este triunfou e removeu de Henrique todos os seus
feudos. A Baviera passou então para a
Casa de Wittelsbach, que controlou a região até 1918.