La configurazione di una specie chimica (ad esempio una molecola) corrisponde alla geometria permanente che risulta dalla disposizione spaziale dei legami chimici intramolecolari della specie chimica in questione. La capacità di un gruppo di atomi di assumere differenti configurazioni per formare specie chimiche di natura differente è detta "stereoisomeria" o "isomeria configurazionale". Ciascuna specie chimica ottenuta modificando la configurazione è detta "stereoisomero".