La Comisión de la Unión Africana es el brazo ejecutivo y administrativo o secretariado de la Unión Africana (UA). Se trata de un organismo similar en cierta manera a la Comisión Europea. Está formada por un conjunto de comisarios encargados de diferentes áreas de política pública del continente africano. La Comisión tiene su sede en Addis Ababa, Etiopía. Debe ser diferenciada de la Comisión Africana de Derechos Humanos y de los Pueblos, con base en Banjul, Gambia, que es un organismo diferente y que informa a la Unión Africana.