Nato nel Dakota del Sud iniziò la sua attività come aiuto regista. Il suo film La casa dei Rothschild (The House of Rothschild, 1935) ebbe una nomination agli Oscar come miglior film. La tragedia di Harlem (Lost Boundaries), partecipò al Festival di Cannes 1949. Morì nello stato della California.
Durante la sua carriera cinematografica, Werker diresse anche un film con i celebri Stanlio & Ollio. Il suo titolo è Sim salà bim.